Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USF2Q15853 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USF2Q15853 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USF2Q15853 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USF2Q15853 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USF2Q15853 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USF2Q15853 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USF2Q15853 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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