Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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