Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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