Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR6A1Q15406 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR6A1Q15406 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms