Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SHPRHQ149N8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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