Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ODF1Q14990 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms