Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO1Q147U7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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