Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SPIDRQ14159 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIDRQ14159 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SPIDRQ14159 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SPIDRQ14159 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SPIDRQ14159 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SPIDRQ14159 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SPIDRQ14159 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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SPIDRQ14159 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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SPIDRQ14159 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SPIDRQ14159 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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