Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA9Q13797 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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ITGA9Q13797 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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