Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1SQ13698 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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