Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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