Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MTM1Q13496 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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MTM1Q13496 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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MTM1Q13496 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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MTM1Q13496 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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MTM1Q13496 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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MTM1Q13496 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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MTM1Q13496 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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MTM1Q13496 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MTM1Q13496 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTM1Q13496 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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