Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FOXE3Q13461 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FOXE3Q13461 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FOXE3Q13461 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FOXE3Q13461 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FOXE3Q13461 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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