Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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