Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms