Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
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