Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSTF3Q12996 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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