Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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