Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
HMGXB3Q12766 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
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