Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 RTC6YPL183W-A 282 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-DR3Q12441 snR61snR61 90 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 PTC5YOR090C 1719 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 VPS3YDR495C 3036 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 MTR4YJL050W 3222 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 EPL1YFL024C 2499 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 ITC1YGL133W 3795 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 VPS53YJL029C 2469 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 RPN2YIL075C 2838 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 ASG1YIL130W 2895 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 SNT1YCR033W 3681 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 SPO21YOL091W 1830 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 ERB1YMR049C 2424 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YOR102WYOR102W 351 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YOR345CYOR345C 351 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 ALA1YOR335C 2877 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 RAD26YJR035W 3258 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 CLN3YAL040C 1743 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YBR099CYBR099C 384 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 BOI1YBL085W 2943 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YJL070CYJL070C 2667 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 KAP95YLR347C 2586 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 TFC8YPL007C 1767 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 SIR3YLR442C 2937 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 TIM11YDR322C-A 291 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 ACM1YPL267W 630 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 FAS1YKL182W 6156 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 SSM4YIL030C 3960 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 DBP7YKR024C 2229 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 RPL6AYML073C 531 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 RSN1YMR266W 2862 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-DR3Q12441 VPS34YLR240W 2628 nt3.34□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 SPT4YGR063C 309 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 GRX8YLR364W 330 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 ORC1YML065W 2745 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 YTA7YGR270W 4140 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 MPH1YIR002C 2982 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 COY1YKL179C 2040 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 GRR1YJR090C 3456 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 EMC6YLL014W 327 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 LYP1YNL268W 1836 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 SNF5YBR289W 2718 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 YLR149CYLR149C 2193 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 YDR341CYDR341C 1824 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 MSK1YNL073W 1731 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 YGR050CYGR050C 357 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 LSM7YNL147W 348 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 RPO21YDL140C 5202 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 CHO2YGR157W 2610 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 FAT1YBR041W 2010 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 AI2Q0055 2565 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 SWI6YLR182W 2412 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 NAB3YPL190C 2409 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 RPB10YOR210W 213 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 PUF4YGL014W 2667 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 STE23YLR389C 3084 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 BMS1YPL217C 3552 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 NCA2YPR155C 1851 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 HYP2YEL034W 474 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 YER053C-AYER053C-A 114 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 snR43snR43 209 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 TRS120YDR407C 3870 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 MYO3YKL129C 3819 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 MPT5YGL178W 2580 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 FMP46YKR049C 402 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 MRPL39YML009C 213 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 SEF1YBL066C 3447 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 TAF6YGL112C 1551 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 TAF1YGR274C 3201 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 HEF3YNL014W 3135 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-DR3Q12441 STU1YBL034C 4542 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 SMY1YKL079W 1971 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 GCR1YPL075W 2358 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 NOG1YPL093W 1944 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 FAP7YDL166C 594 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 YFL065CYFL065C 309 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 SAK1YER129W 3429 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 NUP120YKL057C 3114 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 VPS35YJL154C 2835 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 GIS1YDR096W 2685 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 RLM1YPL089C 2031 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 PXA2YKL188C 2562 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 DIA2YOR080W 2199 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 NPR3YHL023C 3441 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 MDV1YJL112W 2145 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 KSP1YHR082C 3090 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 SLY1YDR189W 2001 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-DR3Q12441 UBP11YKR098C 2154 nt3.24□□□□□ -1.89
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