Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 UBC7YMR022W 498 nt2.27□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 COX7YMR256C 183 nt2.27□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YOR392WYOR392W 444 nt2.27□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YMR320WYMR320W 306 nt2.26□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 VPS52YDR484W 1926 nt2.26□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 SPC72YAL047C 1869 nt2.25□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 AGC1YPR021C 2709 nt2.25□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 ATG31YDR022C 591 nt2.25□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 ATP17YDR377W 306 nt2.25□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.25□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.25□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YOR053WYOR053W 342 nt2.25□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 PES4YFR023W 1836 nt2.25□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 INP51YIL002C 2841 nt2.25□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 TOR2YKL203C 7425 nt2.25□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YJL016WYJL016W 1686 nt2.25□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 PRP6YBR055C 2700 nt2.24□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YDL041WYDL041W 354 nt2.24□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 SDH7YDR511W 402 nt2.24□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 UTP30YKR060W 825 nt2.24□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 RTP1YMR185W 2946 nt2.24□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 MKT1YNL085W 2493 nt2.24□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 BAS1YKR099W 2436 nt2.23□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 TWF1YGR080W 999 nt2.23□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YAR047CYAR047C 321 nt2.23□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 LSM7YNL147W 348 nt2.23□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.23□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YJL070CYJL070C 2667 nt2.23□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 GYP5YPL249C 2685 nt2.23□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YPR089WYPR089W 2667 nt2.22□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 CBS1YDL069C 690 nt2.22□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt2.22□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 SEC22YLR268W 645 nt2.22□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YLR434CYLR434C 384 nt2.22□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 YMR324CYMR324C 243 nt2.22□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 PRK1YIL095W 2433 nt2.22□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 IPT1YDR072C 1584 nt2.22□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 SWT1YOR166C 1377 nt2.22□□□□□ -2.05
LSP1Q12230 COX1Q0045 1605 nt2.21□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 FAB1YFR019W 6837 nt2.21□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 NAN1YPL126W 2691 nt2.21□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 UBR1YGR184C 5853 nt2.21□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 ACB1YGR037C 264 nt2.21□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.21□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 RPS24BYIL069C 408 nt2.21□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 ROX1YPR065W 1107 nt2.21□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 IRC10YOL015W 1761 nt2.21□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 CDC24YAL041W 2565 nt2.2□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 PEP1YBL017C 4740 nt2.2□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 CAJ1YER048C 1176 nt2.2□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YLR287CYLR287C 1068 nt2.2□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 MRPL50YNR022C 420 nt2.2□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 NUP120YKL057C 3114 nt2.2□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 SNU114YKL173W 3027 nt2.2□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 MPH1YIR002C 2982 nt2.19□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 VPS34YLR240W 2628 nt2.19□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.19□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.19□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 ATP7YKL016C 525 nt2.19□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 LCL2YLR104W 396 nt2.19□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 BSC3YLR465C 309 nt2.19□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 REV1YOR346W 2958 nt2.19□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YPL185WYPL185W 396 nt2.19□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YMR045CYMR045C 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 CBF2YGR140W 2871 nt2.18□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 snR79snR79 84 nt2.18□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.18□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 SHE2YKL130C 741 nt2.18□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YBR012CYBR012C 420 nt2.18□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YBR277CYBR277C 402 nt2.18□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 USO1YDL058W 5373 nt2.18□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 UBP11YKR098C 2154 nt2.17□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.17□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 VOA1YGR106C 798 nt2.17□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 URM1YIL008W 300 nt2.17□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 PAU8YAL068C 363 nt2.17□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 PAU20YOL161C 363 nt2.17□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YOR029WYOR029W 336 nt2.17□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 DAS1YJL149W 1992 nt2.17□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YSW1YBR148W 1830 nt2.17□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 VPS16YPL045W 2397 nt2.16□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 GIP3YPL137C 3831 nt2.16□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 DIE2YGR227W 1578 nt2.16□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 MZM1YDR493W 372 nt2.16□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.16□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YFR056CYFR056C 369 nt2.16□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 LSO2YGR169C-A 279 nt2.16□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 GRX8YLR364W 330 nt2.16□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 BFA1YJR053W 1725 nt2.16□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 NCL1YBL024W 2055 nt2.16□□□□□ -2.06
LSP1Q12230 YDR250CYDR250C 276 nt2.15□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 SDC1YDR469W 528 nt2.15□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 EMP24YGL200C 612 nt2.15□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 TMA22YJR014W 597 nt2.15□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 HIT1YJR055W 495 nt2.15□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 RTC6YPL183W-A 282 nt2.15□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 GPX2YBR244W 489 nt2.15□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 PUT3YKL015W 2940 nt2.14□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 PTC5YOR090C 1719 nt2.14□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 YER121WYER121W 345 nt2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.3 ms