Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms