Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNL1Q0VF96 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms