Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYCNQ0VAF6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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