Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCBP1Q09161 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms