Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms