Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GOLGA3Q08378 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms