Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms