Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms