Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LTBQ06643 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LTBQ06643 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LTBQ06643 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LTBQ06643 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LTBQ06643 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms