Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPB1Q06547 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms