Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN11Q06124 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN11Q06124 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms