Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 snR13snR13 124 nt1.82□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YSW1YBR148W 1830 nt1.82□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YDL041WYDL041W 354 nt1.81□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 MSL1YIR009W 336 nt1.81□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.81□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YMR324CYMR324C 243 nt1.81□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 RUF22RUF22 515 nt1.81□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 RPB5YBR154C 648 nt1.81□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 NIC96YFR002W 2520 nt1.81□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 COS111YBR203W 2775 nt1.8□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 USO1YDL058W 5373 nt1.8□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 snR79snR79 84 nt1.8□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YDR250CYDR250C 276 nt1.8□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YGR025WYGR025W 303 nt1.8□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 UTP30YKR060W 825 nt1.8□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 SEC22YLR268W 645 nt1.8□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 CRM1YGR218W 3255 nt1.8□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 SMD1YGR074W 441 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 LSO2YGR169C-A 279 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YLR101CYLR101C 396 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 TIF11YMR260C 462 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 SNC2YOR327C 348 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 RTC6YPL183W-A 282 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 RSA1YPL193W 1146 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 GDS1YOR355W 1569 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 KAR3YPR141C 2190 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 CDC53YDL132W 2448 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 VPH1YOR270C 2523 nt1.79□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 DIS3YOL021C 3006 nt1.78□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 SPC72YAL047C 1869 nt1.78□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 GCN2YDR283C 4980 nt1.78□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YGR042WYGR042W 816 nt1.78□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 TEN1YLR010C 483 nt1.78□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.78□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 YBR032WYBR032W 303 nt1.78□□□□□ -2.12
YHC1Q05900 RIC1YLR039C 3171 nt1.77□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 PUT3YKL015W 2940 nt1.77□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YPR097WYPR097W 3222 nt1.77□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.77□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 CMC2YBL059C-A 330 nt1.77□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 CDC33YOL139C 642 nt1.77□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 SGD1YLR336C 2700 nt1.77□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YOR333CYOR333C 417 nt1.76□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 COX1Q0045 1605 nt1.76□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 AGC1YPR021C 2709 nt1.75□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 TRL1YJL087C 2484 nt1.75□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 IES5YER092W 378 nt1.75□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 FYV12YOR183W 390 nt1.75□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YOR392WYOR392W 444 nt1.75□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 PRM3YPL192C 402 nt1.75□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 CDC60YPL160W 3273 nt1.75□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 LRE1YCL051W 1752 nt1.75□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 SSQ1YLR369W 1974 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 MNE1YOR350C 1992 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 VPS35YJL154C 2835 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 SNF5YBR289W 2718 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 HUR1YGL168W 333 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YKL202WYKL202W 582 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 RPS18BYML026C 441 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YBL108WYBL108W 306 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 EGD1YPL037C 474 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 GPX2YBR244W 489 nt1.74□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 MET18YIL128W 3099 nt1.73□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.73□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YPR146CYPR146C 330 nt1.73□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 VPS34YLR240W 2628 nt1.73□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 VMR1YHL035C 4779 nt1.73□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 RTT101YJL047C 2529 nt1.73□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 RTP1YMR185W 2946 nt1.73□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 CDC27YBL084C 2277 nt1.73□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YDR114CYDR114C 303 nt1.72□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YER121WYER121W 345 nt1.72□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YGL024WYGL024W 336 nt1.72□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 RRT1YBL048W 312 nt1.72□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 ZEO1YOL109W 342 nt1.72□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YPR177CYPR177C 372 nt1.72□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 MNL2YLR057W 2550 nt1.72□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 SPO22YIL073C 2928 nt1.72□□□□□ -2.13
YHC1Q05900 YER135CYER135C 393 nt1.71□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YGL069CYGL069C 465 nt1.71□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 FCF2YLR051C 654 nt1.71□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YCL023CYCL023C 348 nt1.71□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 NOT5YPR072W 1683 nt1.71□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 SMY1YKL079W 1971 nt1.7□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 CDC24YAL041W 2565 nt1.7□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 PET309YLR067C 2898 nt1.7□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 RUD3YOR216C 1455 nt1.7□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YDR286CYDR286C 345 nt1.7□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 HOP2YGL033W 657 nt1.7□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.7□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 IST2YBR086C 2841 nt1.69□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YDR341CYDR341C 1824 nt1.69□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YFL019CYFL019C 354 nt1.69□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 CRG1YHR209W 876 nt1.69□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 ERP4YOR016C 624 nt1.69□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YBR224WYBR224W 516 nt1.69□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 SWT1YOR166C 1377 nt1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.9 ms