Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCZQ05513 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms