Protein–RNA interactions for Protein: Q05166

ASM4, Nucleoporin ASM4, yeastyeast

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Length 528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ASM4Q05166 YHR080CYHR080C 4038 nt2.69□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 NUP120YKL057C 3114 nt2.68□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 snR55snR55 98 nt2.68□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 PHS1YJL097W 654 nt2.68□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 RPS28BYLR264W 204 nt2.68□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 YBR064WYBR064W 429 nt2.68□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 GIS4YML006C 2325 nt2.68□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 MDM1YML104C 3384 nt2.67□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 SSN2YDR443C 4263 nt2.67□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 PAM16YJL104W 450 nt2.67□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 PCC1YKR095W-A 267 nt2.67□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 RPL38YLR325C 237 nt2.67□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.67□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.67□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 SNF5YBR289W 2718 nt2.67□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 PAN3YKL025C 2040 nt2.66□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 AKR1YDR264C 2295 nt2.66□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 FIR1YER032W 2631 nt2.66□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 YGR151CYGR151C 336 nt2.66□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 YHL041WYHL041W 450 nt2.66□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 YOL160WYOL160W 342 nt2.66□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 IES4YOR189W 351 nt2.66□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 RTT10YPL183C 3042 nt2.66□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 SMY1YKL079W 1971 nt2.65□□□□□ -1.98
ASM4Q05166 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 RPA34YJL148W 702 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 HHT1YBR010W 411 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 MAK21YDR060W 3078 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 VPS35YJL154C 2835 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 UBP14YBR058C 2346 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 HRD3YLR207W 2502 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 LRG1YDL240W 3054 nt2.65□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 VPH1YOR270C 2523 nt2.64□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 NPC2YDL046W 522 nt2.64□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 YGL069CYGL069C 465 nt2.64□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.64□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 YML037CYML037C 1023 nt2.64□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 RPL20AYMR242C 519 nt2.64□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 SDC25YLL016W 3147 nt2.64□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 PEX8YGR077C 1770 nt2.64□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 RIC1YLR039C 3171 nt2.63□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 SPO71YDR104C 3738 nt2.63□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 ATG13YPR185W 2217 nt2.63□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 FMP32YFL046W 624 nt2.63□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.63□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.63□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 SNQ2YDR011W 4506 nt2.63□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 GUP1YGL084C 1683 nt2.63□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 YBR184WYBR184W 1572 nt2.62□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 HDA3YPR179C 1968 nt2.62□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 PFD1YJL179W 330 nt2.62□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 YPR063CYPR063C 423 nt2.62□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 VPS16YPL045W 2397 nt2.62□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 SUL1YBR294W 2580 nt2.62□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 TMN3YER113C 2121 nt2.62□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 RRP12YPL012W 3687 nt2.61□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 TAE2YPL009C 3117 nt2.61□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 EFR3YMR212C 2349 nt2.61□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 snR60snR60 104 nt2.61□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.61□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 CYB5YNL111C 363 nt2.61□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 YBR224WYBR224W 516 nt2.61□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 STE6YKL209C 3873 nt2.61□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 INP53YOR109W 3324 nt2.61□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 COS111YBR203W 2775 nt2.61□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 YGR250CYGR250C 2346 nt2.6□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 RGA2YDR379W 3030 nt2.6□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 BFA1YJR053W 1725 nt2.6□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 NMD2YHR077C 3270 nt2.6□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 DYN2YDR424C 279 nt2.6□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 PRE4YFR050C 801 nt2.6□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 YOR296WYOR296W 3870 nt2.6□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 PMR1YGL167C 2853 nt2.6□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 CRM1YGR218W 3255 nt2.6□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 GPG1YGL121C 381 nt2.59□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 SMD1YGR074W 441 nt2.59□□□□□ -1.99
ASM4Q05166 TFC4YGR047C 3078 nt2.59□□□□□ -2
ASM4Q05166 SPO14YKR031C 5052 nt2.59□□□□□ -2
ASM4Q05166 RRP6YOR001W 2202 nt2.58□□□□□ -2
ASM4Q05166 AFI1YOR129C 2682 nt2.58□□□□□ -2
ASM4Q05166 KAP104YBR017C 2757 nt2.58□□□□□ -2
ASM4Q05166 CAF120YNL278W 3183 nt2.58□□□□□ -2
ASM4Q05166 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.58□□□□□ -2
ASM4Q05166 YDR426CYDR426C 378 nt2.58□□□□□ -2
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