Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 SSE1YPL106C 2082 nt2.18□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 NUP82YJL061W 2142 nt2.17□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 GPI8YDR331W 1236 nt2.17□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.17□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.17□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 RPS24BYIL069C 408 nt2.17□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 HIT1YJR055W 495 nt2.17□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 YAR068WYAR068W 486 nt2.17□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 YLR287CYLR287C 1068 nt2.17□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 SPC72YAL047C 1869 nt2.17□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 MKT1YNL085W 2493 nt2.17□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 YEL043WYEL043W 2871 nt2.17□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 NEO1YIL048W 3456 nt2.16□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 PSO2YMR137C 1986 nt2.16□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 RPL40AYIL148W 387 nt2.16□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 YOR105WYOR105W 327 nt2.16□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 FAB1YFR019W 6837 nt2.16□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 YJR098CYJR098C 1971 nt2.16□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 VPS52YDR484W 1926 nt2.15□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 PRP6YBR055C 2700 nt2.15□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 AGC1YPR021C 2709 nt2.15□□□□□ -2.06
RRN11Q04712 MRPL50YNR022C 420 nt2.15□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 UBR1YGR184C 5853 nt2.14□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 SWT1YOR166C 1377 nt2.14□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YMR324CYMR324C 243 nt2.14□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YPL185WYPL185W 396 nt2.14□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 MSL5YLR116W 1431 nt2.14□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.13□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 RAV1YJR033C 4074 nt2.13□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 IRC8YJL051W 2469 nt2.13□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 BRO1YPL084W 2535 nt2.13□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 ATP17YDR377W 306 nt2.13□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YBL071CYBL071C 309 nt2.13□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 RRP12YPL012W 3687 nt2.13□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 COX1Q0045 1605 nt2.13□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YDL041WYDL041W 354 nt2.12□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 RPS20YHL015W 366 nt2.12□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YLR458WYLR458W 381 nt2.12□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.12□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 UTP22YGR090W 3714 nt2.12□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 LEU3YLR451W 2661 nt2.11□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.11□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 URM1YIL008W 300 nt2.11□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 ATP7YKL016C 525 nt2.11□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YML003WYML003W 873 nt2.11□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 UBP2YOR124C 3819 nt2.11□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YPR197CYPR197C 564 nt2.11□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 ECM25YJL201W 1800 nt2.11□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 TAE2YPL009C 3117 nt2.11□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 SAP185YJL098W 3177 nt2.11□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 IST2YBR086C 2841 nt2.11□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 VPS16YPL045W 2397 nt2.1□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YPR089WYPR089W 2667 nt2.1□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 PSK2YOL045W 3306 nt2.1□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YDL068WYDL068W 330 nt2.1□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 CAJ1YER048C 1176 nt2.1□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 LSM7YNL147W 348 nt2.1□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YPL225WYPL225W 441 nt2.1□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YJL070CYJL070C 2667 nt2.1□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 DIE2YGR227W 1578 nt2.1□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 DNF1YER166W 4716 nt2.09□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 YJL016WYJL016W 1686 nt2.09□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 PRK1YIL095W 2433 nt2.09□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 SSQ1YLR369W 1974 nt2.09□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 IRC10YOL015W 1761 nt2.09□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 RTT102YGR275W 474 nt2.09□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 RAM2YKL019W 951 nt2.09□□□□□ -2.07
RRN11Q04712 GIS1YDR096W 2685 nt2.09□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 KOG1YHR186C 4674 nt2.09□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 FKS1YLR342W 5631 nt2.09□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 CDC24YAL041W 2565 nt2.08□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 GCN4YEL009C 846 nt2.08□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 LSO2YGR169C-A 279 nt2.08□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 VTI1YMR197C 654 nt2.08□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YOR121CYOR121C 306 nt2.08□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YBR277CYBR277C 402 nt2.08□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 MGR1YCL044C 1254 nt2.08□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 GYP5YPL249C 2685 nt2.07□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 IPT1YDR072C 1584 nt2.07□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 BAS1YKR099W 2436 nt2.07□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 snR79snR79 84 nt2.07□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 RPS24AYER074W 408 nt2.07□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 CGI121YML036W 546 nt2.07□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YOR146WYOR146W 306 nt2.07□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YPL238CYPL238C 390 nt2.07□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YBR197CYBR197C 654 nt2.07□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 NOP14YDL148C 2433 nt2.07□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 MPH1YIR002C 2982 nt2.07□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 TOR2YKL203C 7425 nt2.06□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 HSL1YKL101W 4557 nt2.06□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 CLN3YAL040C 1743 nt2.06□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 WIP1YDR374W-A 270 nt2.06□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 BRP1YGL007W 378 nt2.06□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 VOA1YGR106C 798 nt2.06□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.06□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 USO1YDL058W 5373 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 TMA22YJR014W 597 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YLR255CYLR255C 354 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.5 ms