Protein–RNA interactions for Protein: Q04201

CUE4, CUE domain-containing protein CUE4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE4Q04201 LCL2YLR104W 396 nt1.03□□□□□ -2.24
CUE4Q04201 YNL226WYNL226W 411 nt1.03□□□□□ -2.24
CUE4Q04201 MNL2YLR057W 2550 nt1.03□□□□□ -2.24
CUE4Q04201 RAD9YDR217C 3930 nt1.03□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 ALK1YGL021W 2283 nt1.03□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 FIG2YCR089W 4830 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YGL218WYGL218W 651 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 CIC1YHR052W 1131 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YHR054CYHR054C 1065 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 BMT5YIL096C 1011 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 RPC25YKL144C 639 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YMR254CYMR254C 309 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 RPB11YOL005C 363 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 RPL33BYOR234C 324 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YPL039WYPL039W 951 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 GRX5YPL059W 453 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 ATP20YPR020W 348 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 CTF4YPR135W 2784 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 KAP122YGL016W 3246 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 BST1YFL025C 3090 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 COX1Q0045 1605 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 CAJ1YER048C 1176 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YGR228WYGR228W 345 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 KAR3YPR141C 2190 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 RLM1YPL089C 2031 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 PHR1YOR386W 1698 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 BRR2YER172C 6492 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 MSH5YDL154W 2706 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 IRE1YHR079C 3348 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 MDS3YGL197W 4464 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 snR83snR83 306 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 RPL37AYLR185W 267 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YNL050CYNL050C 813 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 NOP15YNL110C 663 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 CAT8YMR280C 4302 nt1□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 PEP3YLR148W 2757 nt0.99□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 SGD1YLR336C 2700 nt0.99□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 SPO11YHL022C 1197 nt0.99□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 LRP1YHR081W 555 nt0.99□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 CGI121YML036W 546 nt0.99□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YPR096CYPR096C 303 nt0.99□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.99□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 VPS52YDR484W 1926 nt0.99□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 RSM22YKL155C 1887 nt0.99□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 JIP5YPR169W 1479 nt0.99□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 CTR9YOL145C 3234 nt0.98□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 snR9snR9 187 nt0.98□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YDR220CYDR220C 294 nt0.98□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.98□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 COF1YLL050C 432 nt0.98□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 COX7YMR256C 183 nt0.98□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 APL1YJR005W 2103 nt0.98□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 DOT6YER088C 2013 nt0.98□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 BI4Q0120 1917 nt0.97□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 REF2YDR195W 1602 nt0.97□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.97□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 VPS55YJR044C 423 nt0.97□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 ABM1YJR108W 372 nt0.97□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YPR177CYPR177C 372 nt0.97□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 NCA2YPR155C 1851 nt0.97□□□□□ -2.25
CUE4Q04201 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.96□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.96□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.96□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YCL020WYCL020W 1317 nt0.96□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 DGR2YKL121W 2559 nt0.96□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 TIM10YHR005C-A 282 nt0.96□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YJR087WYJR087W 351 nt0.96□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.96□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YLR271WYLR271W 825 nt0.96□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 SMC4YLR086W 4257 nt0.96□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 EST2YLR318W 2655 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 MTC7YEL033W 420 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 SNO3YFL060C 669 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YGL015CYGL015C 393 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 SCEIQ0160 708 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 CRG1YHR209W 876 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YIR020CYIR020C 303 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YJL015CYJL015C 285 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 ECM9YKR004C 1134 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 SNO2YNL334C 669 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YPL197CYPL197C 414 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 CSM4YPL200W 471 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 SAC3YDR159W 3906 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 MVP1YMR004W 1536 nt0.94□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 MMS22YLR320W 4365 nt0.94□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 snR79snR79 84 nt0.94□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.94□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 FCF2YLR051C 654 nt0.94□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 EGD1YPL037C 474 nt0.94□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YCL046WYCL046W 324 nt0.94□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 FRK1YPL141C 2598 nt0.94□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 OSH6YKR003W 1347 nt0.93□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 Q0255Q0255 1419 nt0.93□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 IES5YER092W 378 nt0.93□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 RPC10YHR143W-A 213 nt0.93□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 HHT1YBR010W 411 nt0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 66.8 ms