Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 NCA2YPR155C 1851 nt0.97□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 TRM732YMR259C 4263 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 EST2YLR318W 2655 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 SPO75YLL005C 2607 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 DFG10YIL049W 762 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YJL015CYJL015C 285 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YJL119CYJL119C 324 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 VPS55YJR044C 423 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 IRC19YLL033W 693 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 FCF2YLR051C 654 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YMR324CYMR324C 243 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YNL010WYNL010W 726 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YBL083CYBL083C 426 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 GUP1YGL084C 1683 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 DPB11YJL090C 2295 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YJR098CYJR098C 1971 nt0.96□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 IRE1YHR079C 3348 nt0.95□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 VAM6YDL077C 3150 nt0.95□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 NOT5YPR072W 1683 nt0.95□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YCR043CYCR043C 384 nt0.95□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.95□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YHL037CYHL037C 402 nt0.95□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 RPL34BYIL052C 366 nt0.95□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 BET4YJL031C 984 nt0.95□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 MLH3YPL164C 2148 nt0.95□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 SWT1YOR166C 1377 nt0.95□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 BNA7YDR428C 786 nt0.94□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.94□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 TIM8YJR135W-A 264 nt0.94□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 RRT15YLR162W-A 189 nt0.94□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 ARV1YLR242C 966 nt0.94□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 URA10YMR271C 684 nt0.94□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 NOP15YNL110C 663 nt0.94□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YOR152CYOR152C 771 nt0.94□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YPR170CYPR170C 336 nt0.94□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 MSN5YDR335W 3675 nt0.94□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 NUP82YJL061W 2142 nt0.94□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YLR149CYLR149C 2193 nt0.93□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 RLM1YPL089C 2031 nt0.93□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 SCC2YDR180W 4482 nt0.93□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.93□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 EGD1YPL037C 474 nt0.93□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 GPX2YBR244W 489 nt0.93□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YCR100CYCR100C 951 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 RTR2YDR066C 591 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 MTC7YEL033W 420 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YGL230CYGL230C 444 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 RNR4YGR180C 1038 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 COF1YLL050C 432 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 CMS1YLR003C 876 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 SEC22YLR268W 645 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YOR364WYOR364W 369 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YPR172WYPR172W 603 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YBR224WYBR224W 516 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 DOT6YER088C 2013 nt0.92□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.91□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 LSO2YGR169C-A 279 nt0.91□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 LCL2YLR104W 396 nt0.91□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 POP7YBR167C 423 nt0.91□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 MSH5YDL154W 2706 nt0.91□□□□□ -2.26
UPS3Q04006 DGR2YKL121W 2559 nt0.9□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 TAD1YGL243W 1203 nt0.9□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 RPC25YKL144C 639 nt0.9□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YNL150WYNL150W 408 nt0.9□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YPL080CYPL080C 327 nt0.9□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 MVP1YMR004W 1536 nt0.89□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YDL068WYDL068W 330 nt0.89□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 ABM1YJR108W 372 nt0.89□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YPT6YLR262C 648 nt0.89□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 MDM32YOR147W 1869 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YJR029WYJR029W 5268 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 RRI2YOL117W 1938 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 MDS3YGL197W 4464 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YGR115CYGR115C 780 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 SEC28YIL076W 891 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YAL066WYAL066W 309 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 CGI121YML036W 546 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YNL114CYNL114C 372 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 RPB11YOL005C 363 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 BEM2YER155C 6504 nt0.88□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 AZF1YOR113W 2745 nt0.87□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YHR054CYHR054C 1065 nt0.87□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 ANS1YHR126C 480 nt0.87□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 MSS11YMR164C 2277 nt0.87□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 PEP3YLR148W 2757 nt0.87□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 KAR3YPR141C 2190 nt0.87□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 SGD1YLR336C 2700 nt0.86□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YGL109WYGL109W 324 nt0.86□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 EMC5YIL027C 426 nt0.86□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.4 ms