Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4A11Q02928 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms