Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms