Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms