Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms