Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM2Q00987 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms