Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms