Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms