Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRB1P82279 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRB1P82279 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRB1P82279 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRB1P82279 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRB1P82279 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRB1P82279 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRB1P82279 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRB1P82279 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRB1P82279 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRB1P82279 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRB1P82279 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRB1P82279 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRB1P82279 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRB1P82279 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRB1P82279 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRB1P82279 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRB1P82279 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRB1P82279 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRB1P82279 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRB1P82279 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRB1P82279 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRB1P82279 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRB1P82279 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRB1P82279 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRB1P82279 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRB1P82279 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRB1P82279 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRB1P82279 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRB1P82279 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRB1P82279 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRB1P82279 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRB1P82279 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRB1P82279 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRB1P82279 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms