Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRX3P78415 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRX3P78415 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRX3P78415 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IRX3P78415 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRX3P78415 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRX3P78415 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRX3P78415 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRX3P78415 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRX3P78415 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRX3P78415 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX3P78415 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms