Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNA1P78396 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms