Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GNB1P62873 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB1P62873 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB1P62873 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB1P62873 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB1P62873 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB1P62873 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB1P62873 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms