Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARF6P62330 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARF6P62330 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARF6P62330 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARF6P62330 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARF6P62330 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms